MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 41588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_016077	ATCAAA	2	12	2482808	2482819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	352685806
41502	NC_016077	CAA	2	6	2482858	2482863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685806
41503	NC_016077	TAA	2	6	2482987	2482992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685806
41504	NC_016077	A	6	6	2483145	2483150	100 %	0 %	0 %	0 %	352685806
41505	NC_016077	GAA	2	6	2483179	2483184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685806
41506	NC_016077	AAAGCA	2	12	2483260	2483271	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	352685806
41507	NC_016077	ACA	2	6	2483352	2483357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685806
41508	NC_016077	CTT	2	6	2483380	2483385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685806
41509	NC_016077	T	6	6	2483399	2483404	0 %	100 %	0 %	0 %	352685806
41510	NC_016077	AAG	2	6	2483420	2483425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685806
41511	NC_016077	T	6	6	2483509	2483514	0 %	100 %	0 %	0 %	352685807
41512	NC_016077	CAA	3	9	2483557	2483565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
41513	NC_016077	CA	3	6	2483576	2483581	50 %	0 %	0 %	50 %	352685807
41514	NC_016077	TGA	2	6	2483602	2483607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685807
41515	NC_016077	CGC	2	6	2483725	2483730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
41516	NC_016077	GAC	2	6	2483732	2483737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
41517	NC_016077	CAT	2	6	2483750	2483755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685807
41518	NC_016077	CCA	2	6	2483766	2483771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685807
41519	NC_016077	AAC	2	6	2483870	2483875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
41520	NC_016077	TAA	2	6	2483953	2483958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685807
41521	NC_016077	CCCATG	2	12	2484009	2484020	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	352685807
41522	NC_016077	A	6	6	2484085	2484090	100 %	0 %	0 %	0 %	352685807
41523	NC_016077	A	6	6	2484139	2484144	100 %	0 %	0 %	0 %	352685807
41524	NC_016077	CCA	2	6	2484172	2484177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685807
41525	NC_016077	AGC	2	6	2484188	2484193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
41526	NC_016077	ACA	2	6	2484207	2484212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
41527	NC_016077	ACAGA	2	10	2484220	2484229	60 %	0 %	20 %	20 %	352685807
41528	NC_016077	GCT	2	6	2484232	2484237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685807
41529	NC_016077	GCC	3	9	2484338	2484346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
41530	NC_016077	GAC	2	6	2484392	2484397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
41531	NC_016077	AGG	2	6	2484413	2484418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685807
41532	NC_016077	AAG	2	6	2484464	2484469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685807
41533	NC_016077	GCC	2	6	2484470	2484475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
41534	NC_016077	ACCATA	2	12	2484500	2484511	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	352685807
41535	NC_016077	ATG	3	9	2484561	2484569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685807
41536	NC_016077	CAA	2	6	2484718	2484723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
41537	NC_016077	TCCA	2	8	2484779	2484786	25 %	25 %	0 %	50 %	352685807
41538	NC_016077	TCA	2	6	2484830	2484835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685808
41539	NC_016077	T	6	6	2484868	2484873	0 %	100 %	0 %	0 %	352685808
41540	NC_016077	T	6	6	2484905	2484910	0 %	100 %	0 %	0 %	352685808
41541	NC_016077	CCT	2	6	2484927	2484932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685808
41542	NC_016077	ATC	2	6	2485034	2485039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685808
41543	NC_016077	GAT	2	6	2485040	2485045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
41544	NC_016077	CCG	2	6	2485059	2485064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685808
41545	NC_016077	T	6	6	2485073	2485078	0 %	100 %	0 %	0 %	352685808
41546	NC_016077	TAT	2	6	2485102	2485107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352685808
41547	NC_016077	TGC	2	6	2485153	2485158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685808
41548	NC_016077	T	6	6	2485166	2485171	0 %	100 %	0 %	0 %	352685808
41549	NC_016077	TGA	2	6	2485323	2485328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
41550	NC_016077	TGA	2	6	2485366	2485371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
41551	NC_016077	T	7	7	2485389	2485395	0 %	100 %	0 %	0 %	352685808
41552	NC_016077	ATTCA	2	10	2485403	2485412	40 %	40 %	0 %	20 %	352685808
41553	NC_016077	AGG	2	6	2485579	2485584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685809
41554	NC_016077	ATG	2	6	2485588	2485593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685809
41555	NC_016077	TTCTT	2	10	2485625	2485634	0 %	80 %	0 %	20 %	352685809
41556	NC_016077	GAT	2	6	2485644	2485649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685809
41557	NC_016077	CATT	2	8	2485710	2485717	25 %	50 %	0 %	25 %	352685809
41558	NC_016077	GCT	2	6	2485728	2485733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685810
41559	NC_016077	T	6	6	2485744	2485749	0 %	100 %	0 %	0 %	352685810
41560	NC_016077	CGCAC	2	10	2485765	2485774	20 %	0 %	20 %	60 %	352685810
41561	NC_016077	AAC	2	6	2485798	2485803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685810
41562	NC_016077	CGC	2	6	2485943	2485948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
41563	NC_016077	TCT	2	6	2485988	2485993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685811
41564	NC_016077	TCTG	2	8	2486020	2486027	0 %	50 %	25 %	25 %	352685811
41565	NC_016077	CATG	2	8	2486057	2486064	25 %	25 %	25 %	25 %	352685811
41566	NC_016077	GAA	2	6	2486086	2486091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685811
41567	NC_016077	ATGT	2	8	2486092	2486099	25 %	50 %	25 %	0 %	352685811
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41570	NC_016077	AAT	2	6	2486234	2486239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685811
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41572	NC_016077	CTG	2	6	2486335	2486340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685811
41573	NC_016077	ACC	2	6	2486373	2486378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685811
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41578	NC_016077	GCC	3	9	2486592	2486600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
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41582	NC_016077	CCT	2	6	2486864	2486869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685811
41583	NC_016077	T	8	8	2486875	2486882	0 %	100 %	0 %	0 %	352685811
41584	NC_016077	ATC	2	6	2486911	2486916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685811
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41587	NC_016077	T	6	6	2487386	2487391	0 %	100 %	0 %	0 %	352685812
41588	NC_016077	CAGA	2	8	2487397	2487404	50 %	0 %	25 %	25 %	352685812

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.